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由试管斜面母种扩大繁殖而成的菌种。因属菌种生产的第二程序，故也称二级种。原种多呈固体状态，一般装于750 ml专用蘑菇瓶中，如谷粒原种、木屑原种、棉籽壳原种等。在食用菌生产上，也有用摇床机摇瓶培养或采用发酵罐深层培养制作液体原种的，但在生产上应用不多。
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