不像单螺杆挤出机的情况，双螺杆挤出机熔化塑料所需要的大部分热量必须从螺杆和料筒壁传导所提供，这就需要使用热的螺杆，因为螺杆表面是主要的有效热传导面积的部位。螺杆是锥形的，熔化聚合物所需要的温度由热传导经过螺杆被传导。
双螺杆挤出机所使用的加热控制器类似于单螺杆挤出机的加热控制器。每一段料筒所使用的独立的控制器是标准的。通常，用于加热和冷却的料筒控制器是带有SCR(饱和铁芯扼流圈)的比例类型产品。熔化热电偶和压力传感器被用于测熔融条件，经常附加的探测头用于适配器的旁边。
有时还需要排出一部分热量，这就要设置“软水强制循环冷却系统”或“压缩空气冷却系统”。