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过量外源氨的存在，阻遏了固氮基因的转录，中止固氮酶合成的现象。化合态氮对固氮基因的调控机制很复杂，大致是，infAL编码的调节蛋白对固氮酶结构基因(nifKDH)和其他固氮基因的控制；固氮基因以外的氮素调节基因(nfr)对nifAL的控制，依外源氮化物存在与否而影响有关基因的表达。由于氨的这种抑制效应，要不断地进行固氮作用，必须将产物氨迅速转化为氨基酸进而合成蛋白质。
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