流感病毒按照病毒核蛋白(NP)和基质蛋白(M1)的不同分为甲、乙、丙三个型，甲型流感病毒又根据病毒粒子血凝素和神经氨酸酶蛋白抗原性的不同分为不同的亚型，以“H*N*”命名，例如甲型流感病毒又可以分成H5N1亚型、H1N1亚型等，各型之间无交叉免疫，可多次感染，反复发病。“H”和“N”分别是病毒表面突起物抗原血凝素和神经氨酸酶的简称，其中H共有15种，N共有9种，因此从理论上说，甲型流感可分为135种之多。乙型和丙型流感病毒主要感染人类，但是甲型病毒除了感染人类以外，还可以感染禽类和马、猪等动物。