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蛋白质分子中氨基酸的前后排列顺序。
这种顺序称为蛋白质分子的一级结构。分析蛋白质或肽链的氨基酸顺序在研究蛋白质功能中是十分重要的工作，因为蛋白质的种类和生物功能均与肽链中氨基酸的排列顺序有关。例如正常人的血红蛋白同镰刀形红细胞贫血病人的血红蛋白的生物功能差别很大，但在分子结构上它们之间只是一个氨基酸的差异。
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