菌落jūn luò单个菌体或孢子在固定培养基上生长繁殖后形成的微生物群落。1948年10月《医药学》复刊版第二卷第六期：“虽温热培养至四十八小时之久，仍无‘菌落’(Colony)产生。” 菌落colony某种菌在固体基质上生长繁殖并向四周蔓延生成肉眼可见的群体。菌落相当于高等生物的群落，指一群动物或植物生活在一起的总体，但菌落常有纯系的概念。因为一个菌落可能由一个以上的细胞所形成，也就是来自不同的细胞，所以常把它挑出后稀释传代，反复进行，直到子菌落相象，而且镜检只含有单一细胞产生的同一类型后代细胞培养物（纯培养）。
菌落的形态有一定稳定性和专一性，是微生物的群体形态，也称培养特征，是分类鉴定的依据之一，在掌握菌种纯度，辨认菌种方面有重要意义，菌落的形态不仅决定于菌落中细胞的特性，也受培养基种类、培养时间、培养条件如温度等的影响； 同时还受其邻近菌落的影响，常可见互相靠近的菌落都较小，而那些分散开的菌落较大。因此在描述菌落形态时，要选择菌落分布比较稀疏处的孤立菌落，并说明培养基种类、培养时间和培养条件。菌落内各个细胞由于所处的空间位置不同，在营养物质的摄取及空气供应等方面也不一样，所以同一菌落中的个体在生理上、形态上或多或少也会有所差异。
细菌菌落 在培养基表面长出的菌落称表面菌落；在表面下形成的菌落称埋藏菌落或深层菌落，常较小，多呈棱镜形。表面菌落形态包括大小，形状、边缘、隆起、光泽、质地、结构、颜色等。细菌菌落大小不一，小的直径不到1mm，大的可以铺满整个培养皿。形状有圆形的，也有不规则的、卷发状的、假根状的等；边缘有整齐的、也有波状的、圆锯齿状的等； 隆起状况有扩展的、台状的、低凸的、乳头状的等； 有的菌落有光泽，有些没有； 有的菌落较粘，有些较脆； 菌落一般呈灰色，但也有白色、黄色、红色、绿色等。有不少细菌以菌落特征命名，例如，蜡状芽孢杆菌(Ba-cillus cereus) 菌落有蜡样光泽； 荧光假单胞菌(Pseu-domonas fluorescens) 菌落有荧光； 蕈状芽孢杆菌(B.mycoides) 菌落边缘有很细密的分枝，类似菌丝；而金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus) 和藤黄微球菌 (Micrococcus luteus)的命名都与这些细菌菌落颜色有关。
细菌菌落特征决定于组成菌落的细胞结构与生长行为。如肺炎链球菌(Streptococcus pneumoniae)具荚膜的就形成光滑型(S-型)菌落，表面光滑、粘稠；不具荚膜的菌株形成的菌落为粗糙型(R-型)，表面干燥、皱褶。炭疽芽孢杆菌(B.anthracis)和蕈状芽孢杆菌细胞生长连成链状，菌落表面粗糙、卷曲、边缘有毛状突起，扫描电镜观察结果，显示菌落特征与其中细胞形状、排列密切相关。
放线菌菌落 较小、干燥、紧密、坚硬而多皱，不易被接种针挑起，当孢子成熟后，表面多粉末状呈不同颜色。有些属、种，如链霉菌(Streptomyces spp.)的气生菌丝和基内菌丝往往有不同颜色，因而菌落正反面颜色不同，还有一些产生水溶性色素扩散到周围的培养基内，常用来作为分类的依据。
酵母菌菌落 与细菌菌落相似，较大而厚多数不透明，表面光滑、湿润、粘稠，呈乳白色，少数红色，表面菌落很易用针挑起。
霉菌菌落 由多分枝的菌丝组成，菌丝较放线菌粗而长，形成较疏松，呈绒毛状、絮状或蛛网状菌落，一般比放线菌和细菌菌落大几倍到几十倍，有些在固体培养基表面生长能迅速扩展，以致菌落无一定大小；有些则有一定局限性。霉菌孢子有不同形状、构造和色素，所以菌落表面往往呈现肉眼可见的不同结构和色泽，有些霉菌菌丝还能分泌色素，扩散到菌落周围培养基内。许多霉菌只在菌落中间部位产生孢子，其边缘菌丝则不产生孢子，菌落表面颜色逐渐变浅或消失，而形成明显的边缘区。菌落外观结构可归纳为： 疏松的、紧密的、平坦的、光滑的、皱褶的、丝绒状的、毡状、絮状、毛状、蜡脂状、皮革状、绳索状等。 菌落colony微生物在固体基质上生长繁殖形成肉眼可见的、具有一定形态结构的子细胞群体。各种微生物在一定条件下形成的菌落特征具有一定的稳定性和专一性，是微生物的群体形态，也称培养特征，是衡量菌种纯度、辨认和鉴定菌种的重要依据之一。以细菌菌落为例，在培养基表面的称表面菌落，在培养基内的叫深层菌落或埋藏菌落。表面菌落特征包括大小、形状、隆起度、边缘情况、表面状况、光泽、质地、颜色、透明程度等。其特征决定于组成菌落的细胞结构和生长状况。 菌落colony细菌在琼脂培养基表面生长时(因只能在一固定点生长繁殖、一般培养20余小时后就可繁殖出亿万个细菌)，堆积成1个肉眼可见的集团，叫菌落。由于各种细菌的组成、构造、色素以及分裂后排列的方式不同，所以形成的菌落形态也不一样。菌落的形态特征是识别各种细菌的重要依据之一。1个菌落中的细菌一般是1个细菌的后代，是纯种。可以利用在固体培养基上形成单个菌落的方法来分纯细菌，或计数原标本中细菌的数目。 菌落又称集落。通常指单个菌体或孢子在固体培养基上生长所形成的肉眼可辨认的微生物集团。特征各异，为鉴别微生物种的依据之一。 |