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系指转位因素向特定位置转移而引起的基因重排而言。定向基因重排有明确的生物学效应，如经过此种重排的两个基因可编码免疫球蛋白分子等。在细胞癌变原理中，细胞内发生定向基因重排可以促进癌基因的过量表达，从而导致代谢调控失常和细胞恶性变。
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