三、新疆维吾尔自治区农业综合开发领导小组及办公室

自治区农业综合开发领导小组及办公室的前身为自治区棉糖基地开发建设领导小组及办公室，成立于1988年。当时领导小组办公室设在水利厅，领导小组成员单位有自治区党委农工部、自治区计委、科委、财政厅、农业厅、畜牧厅、林业厅、轻工厅、土地管理局、供销社、农业银行、农科院、政府办公厅农牧处和生产建设兵团。1989年，自治区棉糖基地开发建设领导小组更名为自治区土地开发建设基金领导小组，办公室改设在财政厅，确定为自治区财政厅代管的非常设机构。1990年12月，自治区土地开发建设基金领导小组及办公室更名为自治区农业综合开发领导小组及办公室，核定编制15名，设综合、项目两组。
主要职责是：统一管理和协调自治区的农业开发工作，组织有关部门对开发建设项目进行筛选审查和立项，负责农业开发资金的分配使用和管理等事项。