网箱养鱼由于环境条件比较优越，只要饲养管理得当，进箱鱼体健壮，一般发病较少，但由于放养密度较大，一旦发生鱼病传染很快，更应予以重视。目前，网箱养鱼中发生的鱼病主要有：肠炎、水霉、中华鳋、中华白皮病、疖疮病、烂鳃、小瓜虫、指环虫、车轮虫、锚头鳋、复口吸虫，其治疗方法可按鱼病防治法予以治疗。但鱼病的防治应坚持“防重于治”的方针，以防为主。
(1)放养前的预防
①加强进箱夏花和鱼种的饲养，保证鱼体强壮，规格整齐。
②拉网、运输和放养操作要小心，防止碰伤鱼体。
③进箱前鱼种要进行消毒，可起到消灭和预防寄生虫的作用。
(2)鱼病流行季节的预防
①鱼种下箱后用漂白粉挂篓。
②用硫酸铜挂袋。
③在鱼病到来前投喂药饵。
④可用枫杨树枝扎把插放于网箱四角。
⑤结合拉网检查，用药物浸洗鱼种。
⑥及时捞取死鱼，注意工具清洁。