（一）爱国卫生运动

1952年，新疆广大农牧区普遍开展爱国卫生运动，使旧社会遗留下来的不卫生状况有了很大改变。1958年，配合《全国农业发展纲要》的全面实施，开展“除四害、讲卫生、灭疾病”的爱国卫生运动，并以此作为“移风易俗、改造国家”的一项经常性活动。1978年以后，农牧区开展卫生达标建设，乡、镇、机关、学校、厂矿均按卫生建设标准，深入开展卫生达标活动。阿克苏、哈密等地区各县市开展灭鼠达标活动，使鼠密率稳定控制在全国“爱委会”规定的范围内。在食品卫生方面，积极采取措施减少疾病的发生。如锡伯族群众中喜爱食用的民族传统食物“米送乎乎”，由于制作方法不当而经常导致肉毒中毒，又称“察布查尔病”（察布查尔锡伯自治县是新疆锡伯族主要集中居住地），经过对食品制作工艺的改革，彻底杜绝了这类疾病的发生。又如，主要发生在南疆地区因营养不良而引起的一种皮肤疾病——癞皮病，经推广种植与食用高色氨酸玉米后，使南疆四地州易发的癞皮病得以控制，发病率由原来40%下降到1985年的4.1%，目前已基本杜绝。
1980年以后，农牧区普遍开展改水活动，先后完成大型改水项目200多个，兴建无塔压力罐自来水供水站300多个，蓄水池200多处，农牧区45%以上居民饮用上了清洁卫生的水。1995年底，全区农牧区改水受益人口达693万，占全区农牧区总人口的62.3%，一些历来缺水的地区，从此结束了饮用河水、渠水、涝坝水的历史。
自治区“爱卫会”把在农牧区推行“双瓮漏斗式”和“通风改良式”卫生厕所，作为自治区农村改厕的主要目标。全区累计新建和改建各类厕所普及率达到85%左右，部分县（市）修建卫生厕所户数已占总农户的80%，其中，呼图壁县改厕成效显著，卫生厕所普及率达85.13%，并获“全国农村厕所建设普及县”和“自治区农村卫生厕所先进县”称号。近年来，通过《食品卫生法》的贯彻实施，新疆农牧区居民普遍提高了食品卫生知识，基本消灭了食物中毒，有效控制了因食物污染而发生的肠胃道传染病的发生与流行，农牧民的健康有了保证。