1658年

日本逮捕耶稣教徒600余人。在英国新议会上，共和派议员对护国政治进行猛烈抨击，护国公克伦威尔再度解散议会。
9月，克伦威尔逝世，其子理查·克伦威尔继任护国公。1659年5月25日，理查·克伦威尔在高级军官的排挤下被迫放弃护国公称号，护国政治结束。年底，伦敦形势极度混乱。
神圣罗马帝国莱茵诸城市如美因兹、科隆、特维尔等组织同盟，瑞典和法王路易十四均参加，称“莱茵同盟”。

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1658年

清定考地方官考成之年垦荒田数。
10月，湖北荆州（江陵）等地霪雨连绵，江水涨溢，淹没田舍，溺万余人。

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1658年

2月，由多罗信郡王多尼（多铎之子）安远靖寇将军统兵三路，罗托等由湖南、吴三桂等由四川、赵布泰等由广西，攻贵州、云南。
5月，清军先后占重庆、遵义、贵阳，又分路进取云南。
郑成功大举兴师北伐，占平阳、瑞安，攻温州。
7月，俄匪军斯捷潘诺夫率500余哥萨克，侵入松花江流域抢掠。清沙尔虎达统兵围截，打死俘获270余人，击毙匪首斯捷潘诺夫。
8月，郑成功船遇飓风退舟山养兵。
12月，清军占安隆、曲靖，桂王出走永昌。

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1658年

有重要史料价值的《明史纪事本末》刊行，凡80卷。撰者谷应泰。
7月，清改内三院大学士为殿阁大学士，正五品。另设翰林院。

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1658年

印度莫卧儿帝国达拉·苏柯战胜其弟舒贾，将其赶至孟加拉。4月25日，在达尔马特战役中却负于穆拉德和奥朗则布联军。6月8日，在萨穆加尔战役中再度失利，逃至德奥达里后被俘杀。6月26日，奥朗则布杀害穆拉德、舒贾，废其父沙·杰罕，自立为帝，号称“世界征服者”。
俄军再度进攻瑞典占领的波罗的海东岸地区，失败，双方签署停战协定，俄瑞战争结束。
俄国沙皇阿列克谢因波兰议会拒绝承认其为波兰国王，再度进攻波兰。波兰国王约翰二世因为期三年的尼米耶扎条约期满，向俄国发起了反攻，最后将俄军赶出立陶宛，1660年进入维捷布斯克和波洛茨克地区。在乌克兰方面，卢鲍米尔斯基在鞑靼人的帮助下，战胜了俄国部队。
法国蒂雷纳子爵亨利率英法联军与西班牙进行沙丘战役，重创西军，占领了西属佛莱芒大批城镇，“大陆的钥匙”敦刻尔克也交给英国人。

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1658年

喻昌完成医学书籍 《医门法律》，总结和发展了中国在伤寒病方面的成就。他批判“变病”说，认为伤寒等传染病是由伏气造成的，如无特殊情况，病症不会改变。在此基础上，他提出温病治疗中的三条纲领，增加了温病学的内容。他因此而成为苏派温病学的先驱。

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1658年

俄人筑尼布楚城。
3月，内监吴良辅因作弊纳贿，伏诛。原大学士陈之遴等因贿结吴良辅被革职流徙。

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1658年

格雷戈里求得旋轮线的一个拱的长度是生成它的圆的半径的8倍。
帕斯卡用无穷小求和法算出了摆线、一曲线与两条平行直线所围图形的面积、旋转体的体积、图形的形心等问题。
帕斯卡著的《摆线理论》一书出版，详尽地研究了摆线。

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1658年

张履祥校订《沈氏农书》，对其不足之处加以补充，完成《补农书》。所补有总论9条、正文22条、附录8条。内容为水稻栽培技术和桑树的种植经验，并记载了《沈氏农书》没有论述到的作物，如桐乡一带种植梅豆、大麻、甘菊和一些瓜果蔬菜等的栽培方法。附录更详细地论述了农家的管理、待人接物等。张履祥于1674年去世。

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1658年

霍布斯的哲学著作《论人》出版，这是他为实现用机械唯物主义观点和几何学方法建立关于物、人和国家的哲学体系的最后一部著作。
伽桑狄的代表作《哲学体系》被收在全集中第一次出版。

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1658年

斯旺默丹[荷]发现血液中的主要成分——红血球。