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被污染的水体通过一系列的物理、化学与生物的作用，逐渐恢复其原有性状的过程。
这一过程包括稀释、沉淀、日光杀菌，水栖生物的拮抗及细菌的生物化学作用。其结果是水体外观恢复污染前状态，分解物稳定，生化需氧量(BOD)大大降低与溶解氧增加，有害物质溶度降低，致病菌死灭，细菌总数减少。
水体自净有一定限度，故不能无限制的向水体内排放污物。
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