（一）畜禽品种

1. 羊。
(1) 绵羊。主要品种有新疆细毛羊、中国美利奴羊(新疆型、军垦型)、和田羊、多浪羊、哈萨克羊、阿勒泰羊、巴什拜羊、巴音布鲁克羊、塔什库尔干羊、柯尔克孜羊、新疆羔皮羊及策勒黑羊。
(2) 山羊。各地州分布较普遍，以阿克苏地区的白绒山羊较有名。
2. 牛。主要地方品种有哈萨克牛、蒙古牛、阿勒泰白头牛和新疆牦牛；培育品种有新疆褐牛；主要引进品种有荷斯坦牛、西门塔尔牛、瑞士褐牛及夏洛来牛。
3. 马。地方品种有哈萨克马、焉耆马和巴里坤马，主要培育品种有伊犁马和伊吾马。
4. 新疆驴。是一种体格小，耐粗饲，适应性强的地方品种。主产于南疆和东疆。
5.驼。新疆驼属双峰驼，产于准噶尔盆地和塔里木盆地边缘以及天山南北坡的荒漠草场，分南疆型和北疆型。新疆双峰驼体大，善驮、挽，耐寒，耐旱，耐粗饲，产毛、产乳、产肉性能较好，是牧区生产上不可缺少的重要驮载工具，其产品也是重要的商品和牧民的生活资料。
6. 马鹿。鹿主要分布在阿尔泰山、天山山地和塔里木盆地，分北疆亚种、东疆亚种、塔里木亚种3个类型。新疆的马鹿体型高大，被毛多为深褐、厚密。我国最大的马鹿饲养基地新疆生产建设兵团农二师三十四团场养鹿场，1995年收锯的一架重量达22公斤的巨茸，在国家农产品博展会上一举夺冠，荣获金奖。
7. 猪。
(1)伊犁白猪。主要产区在霍城、伊宁、新源、巩留、尼勒克等县市。伊犁白猪适应粗放饲养，生产性能较好，瘦肉率较高。
(2)新疆白猪。主要产区在巴音郭楞自治州、石河子、乌鲁木齐和阿克苏等地的农牧团场。该品种生长快，瘦肉率较高，肉质好，适应性强。
8. 家禽。地方品种主要有吐鲁番鸡和新疆鹅。吐鲁番鸡以体大，健壮，善斗著称，是古老的地方鸡品种。吐鲁番鸡生长速度快，饲料报酬高，但骨骼粗大，肉质纤维不够细嫩，产蛋量低。新疆鹅是一个驯化历史不长、驯化程度不高的半野生型品种，主要产区在伊犁和塔城一带。新疆鹅可在草原上自由放牧，饲养管理粗放，适应牧区饲养，它又是一种良好的守户动物，其肉、油、羽绒、肝有较好市场。