肛门被皮肤所封闭而无肛门孔的一种先天性畸形。仔猪最常见，羔羊、驹及犊牛偶然发生。可施行锁肛造孔术，即在肛门突出部或相当于肛门的部位，按正常仔畜肛门孔的大小切一圆形皮瓣，暴露并切开直肠盲端，将肠管黏膜缝在皮肤创口边缘上而形成人工肛门。
肛门闭锁
肛门闭锁实质上是直肠肛门畸形，是常见先天畸形之一，出生婴儿发病率为1:5000，可单独存在或与其他部位畸形并存。广州中山医科大学第一附属医院869例畸形住院儿的分析，其中以消化道畸形居首位共363例，而消化道畸形中，肛门闭锁48例，仅次于巨结肠，居消化道畸形第二位。
肛门闭锁由泄殖腔发育紊乱所致。正常于胚胎第7周。膀胱直肠间隔往下伸，将泌尿生殖窦与后肠分开，后肠向会阴部伸展发育为直肠，而原肛向体内凹入伸展与后肠相接，原肛与后肠间仅有一膜状膈称肛膜，约于胚胎第8周肛膜破裂和消失，后肠与原肛贯通即成为直肠和肛门。如后肠与原肛发育或贯通障碍，则形成各类型的直肠肛门畸形； 如膀胱直肠间隔分隔不全则形成直肠与膀胱、尿道或阴道瘘。
按畸形位置与性质，大致分4型：
❶直肠或肛门部分狭窄但无闭锁。
❷肛管与直肠之间有膜状膈，为未破裂的肛膜称膜样闭锁。
❸肛门与直肠未贯通，直肠远端盲闭，与肛门有一定的距离，原肛处皮肤光滑，色泽正常或稍深，有一深浅不一的窝，刺激该处有括约肌收缩。按直肠盲端与肛门之间的距离可分高位及低位闭锁，目前多以耻尾线为界限（从耻骨中点到骶尾关节的连线），盲闭端在该线上者为高位闭锁，在线下者为低位闭锁。
❹直肠下端闭锁，肛门外形正常，有肛管，但与直肠盲端间有较长的距离。以上4型中以第3型高位闭锁最常见，第1、2型次之，4型最少见。
闭锁可合并各种瘘管，乃直肠末端向尿道、膀胱、阴道或会阴开口而形成直肠泌尿生殖瘘或会阴瘘。合并瘘管的发生率女婴多于男婴。女婴多为会阴瘘或阴道瘘，男婴多为直肠泌尿系瘘。瘘管口的皮肤不具正常肛门的放射状皱褶。
直肠肛门闭锁大多合并其他器官畸形，最常见者为泌尿系畸形(肾盂积水、肾发育不全、尿道下裂、膀胱外翻)，其次顺序为神经系统畸形(脊椎裂、脑积水)、消化道畸形(食管气管瘘、胆道畸形)、骶骨畸形、先天性心脏畸形等。
临床表现依其类型尚不同，多数在生后1～2天即有完全性或不完全性低位肠梗阻症状，出生一天后无胎粪或仅在尿道口、尿布上沾有极少量的胎粪，腹部逐渐膨胀，喂奶后呕吐，以后呕吐物可有粪便臭，呕吐物可被吸入呼吸道引起吸入性肺炎或窒息。仅有肛门狭窄或虽有闭锁但有较大的直肠会阴、前庭或阴道瘘的患儿，可至几个月或1～2岁才出现排便困难、慢性腹胀，腹痛和慢性不完全性肠梗阻症状，生长发育障碍。粪便积于结肠内时间过长可形成坚硬的粪石，也可由于结肠、小肠过度膨胀而出现肠坏死或穿孔。膜状闭锁，膜薄者可在生后第一次探肛时即被穿通，而不出现症状。
凡婴儿出生时肛表不能插入或生后24小时内无胎粪排出者首先应考虑此症。体格检查见会阴部无肛门，或局部仅有一小窝，无胎粪排出即可确诊。膜样闭锁，或低位肛门闭锁者，在肛门附近或会阴处可见皮下积粪 （暗蓝色），患儿哭叫时肛门区有冲击感； 高位闭锁者无此现象。须仔细找瘘管，无瘘管者应于生后12小时作X线摄片，采用倒置位摄腹部及骨盆腔平片，肛口位置放一金属物作标记，结肠内气体上升的终点即为直肠盲端位置，可测得直肠盲端与肛门皮肤（金属物）间的距离，以决定手术方式。如有瘘管时则在会阴部、尿道口、阴道口或其附近有胎粪排出，可用探针由瘘管伸入，低位闭锁者可在肛门附近皮肤处扪及探针，或用钡剂，碘油作瘘管造影，证实盲端位置及瘘管与其他脏器的沟通情况及瘘管大小。此外应注意身体其他部位有无严重畸形。
凡直肠闭锁的患儿均须手术治疗，其预后与闭锁畸形的程度，有无瘘管及并存其他严重畸形有关。合并瘘管而无排便困难的女婴，不必急于进行手术。可待6个月时作瘘管缝合及肛门成形术。