引起食品质变有许多因素，其中最主要的是微生物因素，抑制微生物在食品中的繁殖，有效贮存食品，是食品科学最主要的研究课题，也是食品包装必须解决的问题之一，其中应重点研究包装发生的环境变化对微生物的影响及包装食品可能引起微生物的二次污染问题。
一般将低温冷藏与真空包装并用，低温和CO2并用，低温与放射线杀菌并用。如果是冻藏食品，所采用的冻结包装材料必须耐低温，可以采用NY／PE、PET／PE、BOPP／PE、铝箔／PE，采用托盘包装(PP、HIPS、OPS、PSP)通过真空、封入脱氧剂与低温结合，防止由微生物引起食品变质。