（三）灌溉组织管理

自治区水利厅在原水管处的基础上成立了新疆水利管理总站，各地、州、县、市均设水利（水电）局（处），乡镇设水电管理所（站）,17个较大流域（河系）设立了流域（河系）管理机构。全区基本形成了自治区、地、州、市、县（市）、乡镇4级水管机构组织系统。其组织类型有4种：
❶涉及两个地、州、市的水系，由自治区水利厅直接领导，进行统一管理；
❷涉及两个县（市）以上的水系，或地方和兵团共用的河系，一般由所在地、州、市领导，进行统一管理；
❸兵团自建工程，均由兵团组建管理机构；
❹属于一条渠的河系工程，由渠级组建管理机构。
1995年，全区地方系统由国家管理的各级水管单位有正式职工6 077人，临时工2 139人，其任务主要是灌区干、支渠以上水利工程的管理和分水配水工作；乡（镇）管理的单位，有正式职工3 772人，临时工1660人，主要是管理灌区支渠以下的水利工程。全区共有地方系统水管单位964个，正式职工9 849人，临时工3 799人；兵团水管系统有职工14 367人。在正式职工中，技术干部约占10%，其中具有工程师以上职称的技术人员175人，助理工程师职称的424人，技术员职称的511人。