（三）存在的问题
1.化肥总量不足，施肥水平不高，还不能满足农业生产的需要。四川省化肥每亩播种面积施用量接近全国平均水平，但与某些省市相比仍有一定差距，与先进国家相比差距更大；同时，四川省人口与耕地的矛盾特别突出，根据全省目前施肥水平和农业上新台阶的要求，省农牧厅预测，1995年需要化肥1 100万吨，2000年需要1 250万吨，与1990年实际施用量比，缺口分别为215万吨和365万吨。
2.氮、磷、钾比例失调。按照农业部门要求，氮、磷、钾施用的比例为1:0.5:0.2，而四川省1990年为1:0.27:0.02。由于氮肥相对多，磷肥少，钾肥缺，比例失调。其结果是：
❶化肥的增产效益下降。据省农科院的定位试验，50年代每公斤氮增产的粮食为20—23公斤，80年代下降为10—12公斤；60年代每公斤P2O5增产的粮食为8—10公斤，80年代下降为6—80公斤；
❷土壤缺磷、钾的面积不断扩大。据四川省农牧厅《四川省土壤资源调查及其应用》资料分析表明，全省绝大部分土壤缺钾少磷，有效磷含量小于10ppm的缺磷土壤约占耕地面积的98.8%；有效钾含量小于100ppm的缺钾土壤约占耕地面积的71.3%。
3.施肥方法不科学，浪费较大。由于过分依赖化肥特别是氮肥，不重视有机肥源的开发和利用，既增加了生产成本，又导致土壤有机质含量减少和土壤肥力减退。
今后，要加快发展化肥工业，提高产量和质量，积极组织省外货源。同时要根据土壤普查的成果，从生产到使用改变比例失调的状况，走有机和无机相结合的路子，积极推广配方施肥和复混肥，并针对不同作物和土壤推广使用好微量元素肥料。
（三）存在的问题
新疆主要灌区绝大部分工程是50年代末和60年代修建的，不少已超过或接近其正常使用年限，灌区水利工程普遍存在着老化问题。
(1) 渠首。引水比大、冲沙水量少，是新疆渠首的共同特点，造成不少渠首上下游淤积严重。由于大量泥沙过闸，渠首闸底磨损严重，冲沙、泄洪闸的消能设施均有不同程度损坏，渠首实际引水和抗洪能力有较大的降低。
(2) 水库。1995年，全疆477座水库的总库容为59. 56亿立方米，其中小 （一）型以上的水库中有201座为病险库，水库总淤积量已超过11亿立方米，约占总库容量的18%。同时部分水库防洪标准低，溢洪设施配套差。截至1995年，全区共有100余座水库发生过垮坝事故。
(3) 渠道。由于淤积、冲刷、塌方、衬砌破坏，渠道输水能力普遍下降。比较典型的有乌鲁木齐市和平渠，由70年代改建时设计能力25立方米/秒下降到80年代末的14立方米/秒；墨玉县跃进总干渠由1957年建成时设计能力100立方米/秒下降到80年代末的60立方米/秒。不少渠道无法保证灌溉用水，沙湾县金沟河干渠年引水量由1963年的2.3亿立方米减少为1.6亿立方米左右，造成灌区用水十分紧张。
(4)渠系建筑物。现有的各种渠系建筑物中，约50%已使用20年以上，存在不同程度的老化问题，过水能力降低，如玛纳斯河过河涵洞设计过水能力25立方米/秒，而现在只有16立方米/秒；呼图壁县大海子水库西干渠跌水，原设计过水能力25立方米/秒，损坏后采用临时措施，过水能力仅10立方米/秒。
(5)排水渠道。由于淤积严重，排水效果普遍降低，部分排水渠道因失效而报废，排水渠成为退水渠、泄洪渠。阿克陶伽师总排水干渠长86公里，总造价1 046万元，1987年竣工后，因管理经费得不到解决，无人管理，现下游20余公里原渠深3.5米的渠道已被淤积了2米左右。
(6)机电井。全疆宜井面积约200万公顷，共打井约3.6万眼，1982年有配套机电井2.75万眼，1995年共有机井27 541眼，配套仅2.56万眼。这些机井许多已使用10年以上，虽然年年进行更新改造，但年抽水量增加速度却很慢。1995年，在新打机电井1 331眼的情况下，年抽水量只有25.73亿立方米。不少灌区地下水位下降，造成部分机电井扬程增加，有的地方出现吊泵现象。