菌说

清末哲学论著。清末章炳麟(生平见(訄书》条)著。初系《儒术真论》的附录。写于清光绪二十五年(1899)，同年秋发表于《清议报》第二十八至三十册。
《菌说》以“不知原始，不能反终”作题解。“菌”原出《庄子·齐物论》“乐成虚，蒸成菌”，章炳麟引用西方近代的生物学和医学知识，将其解释为细菌和微生物，以考察生命、物种、人类的自然进化过程。指出宇宙万物都是由原子构成的，“盖万物之初，只有阿屯(Atom)，而其中万殊”。并认为构成宇宙万物的原子是占有一定空间的物质实体。批评了谭嗣同《仁学》中的把“以太”混同于佛教的“性海”错误观点，辨明“以太”并非“心力”，而是构成阿屯的实体，说：“或谓‘性海即以太’。然以太即传光气，能过玻璃实质，而其动亦因光之色而分迟速。彼其实质，即曰‘阿屯’”。由此肯定生命是一种物质现象，并把细胞作为生命原始物质来叙述生命现象，说：“今夫庶物莫不起于细胞。细胞太抵皆球形，其中有核，亦大抵皆球形。核中液体充满，名曰核液，分染色物、非染色物两者。凡细胞诸种，皆自原形质成立。原形质似卵白质，赫胥黎氏称之曰‘生命之本原’……是即生物之所以灵运，然非有神宰畀之矣。”概述了生命现象之基础是物质，并认为物质“相易相生相摩，渐以化为异物”。进而具体论述了各种元素和合而成空气金铁，空气金铁转化为草木，草木变成蜃蛤水母，再递进“为甲节，为脊骨，复自鱼以至鸟兽而为猿、狙、猩、狒，以至为人”这样一个物种起源和生物进化的历史过程。
《菌说》认为自然界没有创造主，自然界的发展变化也没有任何东西在主宰。说：“非有上帝之造之，而物则自造之”，“天运地处，竞无主张纲维也”。并运用生物适应环境的原理，驳斥上帝造人说。但是，《菌说》把生物进过程，归结为精神的作用，“夫自诸异物而渐化为人者，此亦以思自造者也”。这又表现了唯意志论的倾向。
《菌说》强调感觉经验的作用，把感觉等认识能力看作是人的机体的功能，认为声、色、香、味等欲望是各种官骸的需要，说：“盖内有精虫，外有官骸，而人性始具。使官骸皆殒，而精虫独存，则无声、色、香、味诸欲，而独有牝牡之情。”不仅如此，人类的全部认识活动，都是肉体的功能。否认有先验的道德观念，认为人性本无所谓善恶，只有在社会活动中，在人与人的关系和交往上，才表现为善恶，说：“无善无恶，就内容言；有善有恶，就外交言。”并援引英国哲学家培根的话说，“一切道德，皆始自利”，把道德观念的起源归结为自利。
《菌说》还根据进化论思想，反覆强调“合群明分”对于国家、民族御侮图存具有的重要意义：“彼人之自保则奈何？曰：合群明分而已矣。苟能此，则无不自立，譬之蜜蜂，虽细不败。苟不能此，则无不受侮”，“是故合群明分，则足以御他族之侮，涣志离德，则帅天下而路。”因此反对那些洁身自好、自命清高的隐逸人士。认为他们的行为将使民族退化，国家灭亡，“今知不合群致死以自御侮，则后世将返为蛮獠狙获。以此为念，则足以倡勇敢也必矣”。
另有修订手稿，现收藏于北京图书馆。还收入《章太炎选集》和《章太炎全集》，上海人民出版社出版。