| 类 | 科 | 属 | 种 |
| | 归属未定 | 嗜血菌属(Haemophilus) | 流感杆菌，副流感杆菌，溶血性杆菌，
杜克杆菌，副溶血性杆菌，郭魏杆菌 |
归属未定
归属未定 | 巴斯德菌属(Pasteurella)
放线杆菌属(Actinobacillus) | 多杀杆菌 |
| 归属未定 | 链杆菌属(Streptobacillus) | 念珠状链杆菌 |
革兰阴性厌氧
性杆菌 | 类杆菌科
(Bacteroidaceae) | 类杆菌属(Bacteroide)
梭杆菌属(Fusobacteria) | 脆弱类杆菌
核梭杆菌 |
革兰阴性球菌
及球杆菌 | 奈瑟球菌科
(Neisseriaceae) | 奈瑟球菌属(Neisseria)
布兰汉菌属(Branhamella)
摩拉菌属(Moraxella)
不动杆菌属(Acinebacter) | 脑膜炎球菌，淋球菌
卡他球菌
慢性结膜炎杆菌
多形模仿菌 |
革兰阴性厌氧
性球菌 | 费氏球菌科
(Veillonellaceae) | 费氏球菌属(Veillonella) | 碱性费氏球菌 |
革兰阳性球菌
需氧或兼性厌
氧性球菌 | 细球菌科
(Micrococcaceae) | 细球菌属(Micrococcus)
葡萄球菌属(Staphylococcus) | 四联球菌
金黄色葡萄球菌，表皮葡萄球菌 |
链球菌科
(Streptococcaceae) | 链球菌属(Streptococcus) | 甲、乙、丙型链球菌，肺炎球菌 |
| 厌氧性球菌 | 消化球菌科
(Peptococcaceae) | 消化球菌属(Peptococcus) | 消化球菌 |
消化链球菌属(Peptostreptococcus)
八叠球菌属(Sarcina) | 消化链球菌
八叠球菌 |
形成芽胞的杆
菌或球菌 | 芽胞杆菌科
(Bacillaceae) | 芽胞杆菌属(Bacillus)
梭形芽胞杆菌属(Clostridium) | 炭疽杆菌，枯草杆菌等
破伤风、产气荚膜、肉毒杆菌等 |
革兰阳性无芽
胞杆菌 | 乳杆菌
(Lactobacillaceae) | 乳杆菌属(Lactobacillus) | 嗜酸乳杆菌 |
归属未定
归属未定 | 李斯德菌属(Listeria)
丹毒丝菌属(Erysipelothrix) | 单核细胞增多性李斯德菌
猪丹毒杆菌 |
放线菌及有关
微生物 | 棒状杆菌科
(Corynebacteria-
ceae) | 棒状杆菌属(Corynebacterium) | 白喉杆菌，类白喉杆菌 |
丙酸杆菌科
(Propionibacteria-
ceae) | 真细菌属(Eubacterium) | 迟钝真杆菌，粘真杆菌 |
放线菌科
(Actinomyceta-
ceae) | 放线菌属(Actinomyces) | 牛型放线菌 |
分枝菌科
(Mycobacteria-
ceae) | 双歧杆菌属(Bifidobacterium)
分枝杆菌属(Mycobacterium) | 结核杆菌，麻风杆菌 |
奴卡菌科
(Nocardiaceae) | 奴卡菌属(Nocardia) | 星形奴卡菌 |
链霉菌科
(Streptomyceta-
ceae) | 链霉菌属(Streptomyces) | |
| 立克次体 | 立克次体科
(Rickettsiaceae) | 立克次体属(Rickettsia) | 斑疹伤寒，恙虫热立克次体 |
衣原体科
(Chlamydiaceae) | 衣原体属(Chlamydia) | 沙眼衣原体 |
| 支原体 | 支原体科
(Mycoplasmata-
ceae) | 支原体属(Mycoplasma) | 肺炎支原体 |