病毒核糖核酸

病毒核糖核酸是作为病毒遗传信息载体的一类RNA，包括噬菌体RNA、植物病毒RNA、部分动物病毒(RNA肿瘤病毒等)RNA和类病毒RNA等。
噬菌体核糖核酸 作为噬菌体遗传信息载体的RNA。RNA噬菌体如R17、MS2、Qβ和f2 等具有相似结构的RNA。它们都是多顺反子结构的，类似于原核mRNA。噬菌体MS2 RNA是第一个测定了全部核苷酸序列的RNA噬菌体，它由3569个核苷酸构成，包括四个顺反子（图）。整个MS2 RNA是一条单链，其5′端为鸟苷三磷酸，由5′端向3′端顺次是5′端非编码区 (129个核苷酸),A蛋白（成熟蛋白）基因(1179个核苷酸)，终止密码子和间隔区(26个核苷酸)，外壳蛋白基因 (390个核苷酸)，溶菌蛋白基因(225个核苷酸)，复制酶基因(1635个核苷酸)及终止密码子和3′端非编码区(174个核苷酸)。其中溶菌蛋白基因有189个核苷酸与相邻两个基因共用。整个分子中无修饰核苷酸。噬菌体MS2RNA 具有花束状的二级结构，分子内存在着丰富的二级结构。

噬菌体MS2 RNA结构示意图

高等动植物病毒核糖核酸 作为高等动植物病毒遗传信息载体的一类RNA。高等动植物病毒RNA 的结构类似于真核生物mRNA的结构，即一般由5′端帽子结构，5′端不翻译区，翻译区，3′端不翻译区和3′端聚腺苷酸构成。有的没有5′端帽子结构或3′端聚腺苷酸。一些植物病毒RNA有类似tRNA结构的3′末端，并能接受氨基酸。与真核生物mRNA一样，高等动植物病毒RNA也是单顺反子，但通常病毒mRNA先被翻译成一个大的蛋白质，然后再被裂解成几个较小的具有生物活性的蛋白质。
人脊髓灰质炎病毒RNA是第一个测定了全部核苷酸排列顺序的病毒RNA，它由7433个核苷酸组成，具有典型的高等动植物病毒RNA的特征。有一个特殊的通过5′末端磷酸根与一个小蛋白共价相连接的5′ 末端 (不同于通常含有m7G的帽子结构)。随后依次是5′端非翻译区(740个核苷酸)，翻译区(6621个核苷酸),3′端非翻译区(72个核苷酸)和3′ 端聚腺苷酸。人脊髓灰质炎病毒RNA的特殊的5′末端有一条由22个氨基酸构成的肽链，通过N端第3个氨基酸（酪氨酸）上的羟基与其5′端尿苷酸的磷酸根共价地相连接。这个肽段是由病毒本身编码的。该病毒的5′ 端不翻译区构成一个发夹结构(其对应的核苷酸是9～36)，这个区域与调节和辨认功能有关。而其蛋白质末端可能与RNA 合成的起始有关。虽然RNA上结构基因的翻译起始于大的阅读框架 (在第741个核苷酸开始)，但在741的前面，即5′端不翻译区，有8个不作起始信号的AUG。这些AUG 是潜在的起始点，有的后面紧跟着终止信号。其中有3个起始点如果翻译启动的话可合成3个肽段。这些潜在的编码序列的意义还不清楚。
翻译区由2207个连续的三联体密码子共6621个核苷酸构成，占整个病毒核苷酸总数的89%，翻译产生一个大的蛋白质，然后裂解成十多个有生物功能的肽段和一个有22个氨基酸残基的作5′端帽子的肽段。裂解点通常位于谷氨酰胺和甘氨酸连接处。其翻译终止信号由连续的二个终止密码子(UAG和UAA)构成。
3′端不翻译区有72个核苷酸，缺乏在真核mRNA中存在的AAUAAA添加聚腺苷酸信号。这暗示病毒RNA的聚腺苷酸是由病毒负链RNA的5′端聚尿苷酸转录产生的。该病毒RNA的聚腺苷酸长度不均一，平均长度为60。聚腺苷酸的功能可能与负链RNA的合成起始有关。
除人脊髓灰质炎病毒RNA外，已用同样方法即测定cDNA序列的方法测定了烟草花叶病毒和人的鼻病毒14RNA等的全部核苷酸排列顺序。
类病毒核糖核酸 高等植物的病原体，单链环状的RNA分子。通常由200～400个核苷酸组成，分子量约12万。已经发现的类病毒有十多种。
马铃薯块茎纺锤状病类病毒(PSTV)是Diener等人在1967年发现的类病毒，是一个无蛋白外壳的裸露的RNA分子，沉降常数为10s。这种低分子量的RNA分子一旦进入寄主细胞，便在其中复制。电镜观察PSTV，其分子平均长度为50nm，有近似DNA双链的宽度(20)的棒状结构。1978年Gross小组测定了PSTV的一级结构，整个分子是由359个核苷酸组成的环状RNA。这个结果与Diener 推测的性质是一致的。整个分子具有高度的二级结构，359个核苷酸中约有244个处在碱基配对之中(占68%)，分子像一根僵直的棒。整个序列中没有发现真核生物mRNA通常使用的起始密码子AUG，但GUG却有七处。终止密码子(UAA、UAG和UGA)有六处。类病毒分子如此之小以至于所带的信息量仅够编码一个蛋白质。它进入寄主以后如何复制自己，如何干扰寄主的正常复制机制，它本身结构的生物学意义是什么，感染活性的结构基础又是什么？所有这些问题都有待于进一步探讨。迄今已测定了一级结构的类病毒还有菊花矮缩病；鳄梨日灼病和柑橘脱皮病等的类病毒，它们都是单链环状RNA分子，其特征与PSTV相同。