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在同一染色体上，位置邻近而紧密连锁，功能相关，有相似表型效应的基因。有类似等位基因的作用，但不具有与等位基因相同的结构，而且在顺反位置效应测验中，没有互补作用，不能等同于等位基因。常被看做是复合基因座中不同的基因位点，或基因内可分割的成分和功能单位(见“顺反子”)。
表型效应相似，功能上密切相关，染色体上的位置又紧密连锁的基因。
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