座囊菌目Dothideales

子囊果为子囊座，子囊具双层壁，束生于子囊腔基部，子囊间无侧丝的真菌。属于子囊菌亚门、腔菌纲。至1971年约100属400种左右，为害植物引起叶斑、溃疡和腐烂等症状。
1897年林道(Gustav.Lindau)首先建立座囊菌目，当时归属于核菌类，其下仅有座囊菌科。1915年泰森(Ferdinand Theissen)和赛多(Hans Sydow)将该目分为座囊菌科、黑痣菌科、多口壳科和蒙塔假菇科等四个科。1955年美国勒特雷尔(Everett StanleyLuttrell)最早提出腔菌，作为子囊菌的一个亚纲，1965年将座囊菌目归入腔菌纲。D.L.霍克斯沃思(DavidL. Hawksworth) 等人1983年 的 《真 菌词 典》(Dictionary of the Fungi,7th,ed.)将多腔菌目和格孢腔菌目降为多腔菌科和格孢腔菌科，也归属在座囊菌目内，分为52个科，包括655属，6270种。这里采用E. S.勒特雷尔(1973)的分类系统，本目分为8个科，重要的科为煤炱科(Capnodiaceae)和座囊菌科(Dothideaceae)。煤炱科子囊座外生，顶端有孔口或无； 菌丝暗色，由圆形细胞组成，腐生在蚜虫或介壳虫分泌的“蜜露”上，对植物的影响主要是遮光，阻碍光合作用。座囊菌科子囊座子囊壳状，内生或半内生，顶端有拟孔口，子囊在子囊座内束生，无拟侧丝，很多种寄生在维管束植物上。重要的属如下。

葡萄球座菌(Guignardia bidwellii)
1.子囊座； 2.子囊及子囊孢子； 3.分生孢子器；4.产孢细胞及分生孢子
(仿Sivanesan)

煤炱属(Capnodium Mont.) 菌丝体表生，绒毛状，暗褐色，由圆形细胞组成。子囊座无刚毛，表面光滑，或有菌丝状附属丝。子囊孢子多细胞，具纵横隔膜，砖格状，褐色。菌丝层着生在植物表面，像一层黑纸，很容易剥下来。至1983年该属已知有15种，中国报道5种。常见的种是引起柑桔煤病的柑橘煤炱(C.citri Berk. et Desm.)。
球腔菌属(Mycosphaerella Johns.) 子囊座球形或亚球形，散生在寄主的表皮下，后突破寄主表皮外露。子囊座有孔口，无喙。子囊圆筒形或棍棒形，束生，子囊间无拟侧丝。子囊孢子无色，椭圆形，中间有一横隔膜。在寄主植物上引起叶斑。至1983年该属已知约500种，中国报道65种。常见的种有引起花生褐斑病的花生球腔菌[M.arachidicola (Hori) Jenk.]和引起柑橘脂点黄斑病的柑橘球腔菌(M.citriWhiteside)。
球座菌属 (Guignardia Viala et Revdz) 至1983年该属已知有40种，中国报道10种。常见的种是引起葡萄黑腐病的葡萄球座菌[G.bidwellii (Ell.)Viala et Ravaz]（见图）。主要形态特征与球腔菌属相似，而子囊孢子无隔单孢，这与球腔菌属不同。在寄主植物上引起叶斑和果腐。

座囊菌目Dothideales

子囊菌亚门，腔菌纲。菌丝有隔膜。菌丝体繁茂，淡色至暗色。有性生殖时形成的子囊座表生或埋生，小型，垫状、扁球形至球形，顶部解体成假孔口与子囊腔相通。子囊腔常单个生在子囊座内，每个子囊腔中有多个子囊。子囊圆筒形或棍棒形、卵圆形，壁双层，外壁无延伸性，有或无柄，束生，子囊间无拟侧丝。子囊孢子8个，椭圆形或纺锤形，常双胞，少数种多胞或单胞，无色或褐色。无性态为壳针孢属(Sep-toria)、茎点霉属(Phoma)和尾孢属(Cercospora)等。陆生，寄生或腐生，营寄生的种类引致叶斑和果腐等症状。本目有煤炱科和座囊菌科等8科，含煤炱属、球腔菌属和球座菌属等约200属。