盐湖盆地是区域的低洼处，如降雨量较大，盐湖周围又有一定面积的汇水区域和一定的坡度，降水后不能及时渗入地下，在地表面形成明流，顺坡而下，侵入盐湖，就会形成季节性的洪水灾害。
洪水携带大量粘土、亚粘土等极细颗粒状物质和枯枝落叶、牲畜粪便等杂物，淤积于盐湖表面，埋压和污染盐湖，增添卤盖中的泥沙；淡水进入湖内，使原来结晶很好的盐层溶成蜂窝状，泥沙同时进入盐层孔隙，盐层中不溶物大量增加；湖周矿物杂质被洪水迳流溶融后带入盐湖矿床中，增加矿床的有害组分。
洪水入湖冲毁盐坨、盐道，溶蚀设施，影响生产，甚至造成停产。吉兰泰盐场自1970年机械化生产以来，凡是7、8两月降雨量超过55mm的年份，均被迫中断生产。1970－1980年累计原盐采掘生产日1745天，因洪水发生被迫停产131天，占7．5%。
为了防洪防淤，可营造水土保持林和修筑防洪堤坝、改造淤泥滩。