流感患者的肺部并发症主要有以下三类：
(1)继发细菌性上呼吸道感染：如咽喉炎、中耳炎、鼻窦炎、支气管炎，因病毒破坏了呼吸道黏膜上皮细胞，损害了呼吸道的自然防卫功能，细菌乘虚而入引起感染。
(2)继发细菌性肺炎：可在流感病情好转后发生，也可与流感病毒性肺炎同时存在，起病2～4天后病情加重，发热并有寒战，全身中毒症状明显，咳嗽增剧，咳脓痰，伴有胸痛。体检可见患者呼吸困难，紫绀，肺部满布啰音，有实变或局灶性肺炎征。可出现胸膜炎、胸腔积液或脓胸。白细胞和中性粒细胞显着增高，常见致病菌有肺炎球菌、金黄色葡萄球菌、流感杆菌。有不少老年人及慢性病患者感染流感后继发肺炎，甚至死亡。
(3)病毒与细菌混合性肺炎：流感病毒与细菌性肺炎同时并存，起病急，高热持续不退，病情较重，可呈支气管肺炎或大叶性肺炎，除流感抗体上升外，也可找到病原菌。