水运企业在运营过程中不可避免地会发生各种事故损失。如海损事故损失，即由于船舶碰撞、搁浅、触礁、遭遇风灾水灾等所发生的损失，包括对外赔偿费用、船舶修理费用、海难救助费和善后处理费等；机损事故损失，指由于营运船舶的锅炉、主机、轴、推进器等发生故障、损坏造成的损失，包括修理费、船舶检验费、拖带费、赔偿费等；商务事故损失指在营运进程中因船方责任发生的货损、货差等事故损失，如因货物短少、损坏、受潮、污染而支付给货主的赔偿费用。水运企业事故损失，是企业船舶运营费用的组成部分，记入“运输支出”科目。发生事故损失时，借记“运输支出”科目，贷记“材料”、“银行存款”等科目。向保险公司投保收回的赔偿收入。办理共同海损收回的赔偿款，以及应由事故对方或过失人负担的部分，借记“银行存款”、“其它应收款”科目，贷记“运输支出”科目。年终，对于当年不能结案的事故，企业可根据有关资料，计算出应付事故费用，列入当年的营运成本，借记“运输支出”科目，贷记“预提费用”科目；待事故结案时，将实际费用与预提数的差额，调整结案年度的营运成本。