石榴种子易保存，且发芽力强，便于用种子繁殖，但种子繁殖变异大，故多用于育种、培育砧木或盆栽苗。
石榴充分成熟时采果，取出种子，搓去外种皮并洗净阴干后立即进行沙藏层积。待翌年3月份取出播种。播种时选肥沃的砂壤地，播前每公顷撒优质农家肥52500～57500千克，经深耕细耙，平整作畦。按行距30厘米开沟播种，播深1．5厘米左右。每公顷用种45～75千克，可出苗75万株。播后忌畦内漫灌，以免地板结，降低出苗率。播后10～15天天旱时可喷水抗旱。幼苗出土至嫩茎木质化期间，要适当控制灌水，进行蹲苗，6～8月每月可施速效氮肥一次，每次每公顷施尿素150～187．5千克。8月中旬以后要控制灌水和施氮肥，以利苗木充实。这样当年苗高可达50厘米，可以定植或作砧苗用。