在一个群体内，某一基因型个体数占总个体数的比值。
以Aa一对基因为例，用D′、H′、R′分别代表三种基因型AA、Aa、aa的个体数，D′+H′+R′=N。三种基因型的频率为：
，
，
，D+H+R=1。
若以p代表A基因频率，q代表a基因频率，则基因频率和基因型频率的关系为：
，
。是组成群体遗传结构的因素，在群体遗传学和进化遗传学中，为一个重要的研究指标。
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