（二）第二阶段(1978—1990年)

1978年全国科学大会上把农业资源调查和农业区划列为108项重点科技攻关计划的第一项，这是党中央、国务院为科学地指导农业生产而作出的一项重大决策。云南的农业区划工作按照国家的统一部署，省委、省政府于1979年和1981年先后召开了全省第一次和第二次农业区划工作会议。省政府发出[1981]123号文件，省委、省政府联发[1982]28号文件，对全省农业区划工作进行了安排部署。在各级党委和政府的领导下，省地县三级全面、系统地开展了农业区划工作。这一时期，农业区划工作在进行的深度和广度；内容的科学性、实用性；成果的应用与效益；组织建设和业务建设；理论和方法的研究等方面都有重大进展。全省应开展农业区划的127个县(市、区)中，除一个县情况特殊外，有126个县(市、区)完成了国家规定的县级资源调查和农业区划的阶段性任务。地、州、市级综合农业区划有16个地州市通过评审验收。全省综合农业区划于1980年编印出草案本。全省省地县三级进行了资源调查和部门专项区划，普遍组织开展了土地、水、气候、生物四大自然资源和社会经济技术条件的调查，并进行了分析评价，初步摸清了资源的数量、质量和时空分布状况，为资源的合理开发利用和保护增值提供了依据。省级完成了地表水、热带作物种植业、农业种植业(包括14个主要作物)、畜牧、水产、农业机械、农业气候、土壤、草山草坡、畜禽品种、农作物品种、农作物害虫天敌、中药材等调查或普查，还完成了综合自然区划、紫胶区划、香料区划、农田草害防除及利用区划、自然保护区考察等总共近20个项目。同时，对林业资源和土地资源进行了调查。
结合资源调查和农业区划，云南省还不同程度、不同层次地开展了农业有关重大问题的发展战略研究和专题研究、区域开发综合规划等工作。先后编写了西南高原山地（云南部分）农业发展战略研究，测量了全省不同海拔、不同坡度和气候带的土地面积。先后参与全省农业环境预测研究，全省烤烟、卷烟发展战略研究，中国西部11省（区）农村经济发展战略研究，滇、黔、桂3省（区）石灰岩地区农村经济发展规划，云南省生物资源合理开发利用战略研究，云南亚热带丘陵山地开发研究，西双版纳州区域开发规划，干热河谷重点区域资源开发和治理规划，以及一些县的资源开发规划等重大问题的研究和区域开发规划工作。各地州市县还从本地发展农业生产和农村经济的需要出发，开展了不同规模、不同层次、不同地域类型、不同项目的各级各类规划工作。