（一）改革企业领导体制

兵团农场企业领导体制是从50年代起按照军队建制建立的党委领导下的首长分工负责制。在管理上是军事化集权型的，调节方法是指令型的，政企关系是混合型的，企业方向是生产型的。这种体制，在开荒建场、发展生产、减轻民负、繁荣经济、巩固边防等方面，都曾起了积极作用。多年来新疆农垦经济管理体制虽曾发生过多次变化，但主要是改变企业的隶属关系，并未解决企业的经营自主权问题。农牧团场管理机构，按照军队编制加上生产机构，最突出的特点是管理层次多，机构重叠，企业没有经营自主权。中共十一届三中全会以后，兵团企业领导体制进行改革，大体经历了4个阶段：
1. 实行党委领导下的首长分工负责制。改革初期，主要是土地承包制度的改革，领导体制仍沿袭原来的办法，实行党委领导下的首长分工负责制。党委对所有企业、生产、行政部门、职代会、工会、共青团等组织实行统一领导，决定企业人财物、党政军等一切重大问题，决定企业生产经营管理的重大问题，领导党的建设和思想政治工作，团长在党委领导下对企业的生产经营活动实施指挥，职代会在党委领导下工作，讨论、决定诸如职工福利基金的使用等有关职工利益问题，监督企业领导干部并对其提出奖惩、任免建议等。
2.推行承包经营。1987年随着全国企业经营改革的步伐加快，兵团农场实行了企业承包经营，并在领导体制上进行了重大改革，即按照《全民所有制工业企业法》实行场长负责制。场长的聘用采取招标承包、竞争上岗的办法，承包场长有聘用副职以下干部的权力，党委按企业党组织工作条例实行保证监督。1987年，首先在工交建商企业实行承包经营。接着农场全面推行了企业承包经营责任制。这项改革调整了兵团、师局与企业的关系，使企业成为相对独立的经营实体，从而为企业的发展注入了新的活力。
3.改革回潮。1989年治理整顿开始后，兵团党委决定恢复团场党委领导下的场长负责制。一些连队比照团场的办法，也实行党支部领导下的连长负责制。取消了招标承包和经营承包的办法，造成了改革的回潮。团场不给团办企业法人地位，不准企业独立开户经营，团办企业人员由团调配，财务由团掌管，造成兵团改革滞后，经济发展缓慢，与全国及先进垦区的差距拉大。
4.构筑团场经济新体制框架。中共十四届三中全会《关于建立社会主义市场经济体制若干问题的决定》，为兵团克服改革滞后，加大改革力度，尽快赶上全国经济体制改革的步伐，创造了机遇，也为兵团改革领导体制创造了良好的环境。兵团党委决定，按照中央精神创立兵团团场现代企业制度，并在此基础上构筑兵团团场经济新体制的框架。这个新框架就是：公司制，多法人，统分结合，双层经营。农场建立由股东会、董事会、监事会和经理层构成的公司领导管理体制，保证责权利明确，各司其职，有效行使决策、监督和执行权。管理部门的设置及职能严格按《中华人民共和国公司法》及有关规定执行。这是兵团企业领导体制根本性的改革。