（一）农业综合开发区的建设内容

根据国家农业综合开发的统一部署，云南省农业综合开发主要建设内容进行了三次大的调整：
1.第一次调整(1990—1993年)。这期间，云南省3年人均粮食占有量仅为282千克，比全国同期年人均粮食占有量少88千克，每年从省外纯调入粮食10亿千克左右。针对当时粮食总量不足，供给不能自求平衡的状况，云南省农业综合开发以增加粮油肉等主要农产品产量，增强农业发展后劲为主要目标，以改造中低产田、开垦宜农荒地，推广农林水气科技成果为主要内容，大力改善农业生产基础条件，把建设重点放在了兴修水利、植树造林、推广良种等农业基础设施建设方面，用于改善农业生产条件的资金占投资总额的83%以上。这一时期，农业综合开发以水利为龙头，以改造中低产田为主。水利工程以小型蓄、引、提，灌区渠系配套为主。3年期间，新建小型水库14座，改扩建17座，新增库容5 607万立方米，渠系配套1 398千米，其中硬化衬砌746千米，新建桥涵闸2 248处，电力提灌站10处，装机2051千瓦，农田防护林防护面积5.13万公顷，改良土壤6.8万公顷，扩大良种种植面积8.73万公顷。
2.第二次调整(1994—1997年)。国家提出发展“高产、优质、高效”农业，国家农业综合开发办公室根据全国的农业形势和任务，对《国家农业综合开发项目管理办法》进行了修订。新的项目管理办法把农业综合开发项目划分为两类项目：土地治理开发项目与多种经营项目，提出把不低于财政投资的70%资金用于农业综合开发土地治理，把不超过财政投资的30%资金用于农业综合开发多种经营项目。改变了过去单一进行农田基础设施建设的做法，增加了种植业（非粮棉油类）、养殖业、农副产品加工业的资金投入。1994—1997年云南省农业综合开发在完成改造中低产田6.13万公顷的同时，重点抓了一大批“贸工农”一体化的农产品商品基地。第一是围绕龙头企业建基地。如思茅、临沧、保山、德宏等项目区先后为龙头企业建设了1万公顷的甘蔗种植基地；3333.3万公顷的云南小粒咖啡基地；1 333.3万公顷的无性系生态茶种植基地。第二是围绕市场建基地。先后发展了元谋、宾川、东川、华坪等冬季反季蔬菜面积共6666.6万公顷。第三是突出特色建基地。如西双版纳州、景谷、永德等县的3 333.3万公顷芒果、荔枝、龙眼、菠萝种植基地；罗平、腾冲县的2000公顷银杏种植基地等。农业综合开发区通过大规模的商品基地建设，使项目区群众的经济收入的数量和结构发生了根本性的变化。
3.第三次调整(1998年后)。国家农业综合开发联席会议提出“两个转变”的指导思想和工作思路，即由过去的改造中低产田和开垦宜农荒地相结合，转到以改造中低产田为主，尽量少开荒甚至不开荒，把农业综合开发与保护生态环境有机结合起来；由以往追求增加主要农产品产量为主，转到积极调整结构，依靠科技进步，努力发展优质、高产、高效农业上来，并提出农业综合开发要与农业结构调整相结合，要积极推动农业科技进步，要有利于保护和改善生态环境。根据上述精神，1999年国家农业综合开发办公室进一步修订了《国家农业综合开发项目和资金管理办法》。新的办法提出“农业综合开发以改造中低产田，改善农业基本生产条件为重点，不断提高农业综合生产能力。同时，依靠科技进步，优化品种结构，提高农产品质量，大力发展高产优质高效农业，促进农业实现产业化经营，切实增加农民收入。并有选择地建设现代化农业示范区和科技示范区，推动我国农业现代化进程”。新办法还把农业综合开发项目分为三类：一类为土地治理项目，包括中低产田改造，宜农荒地开垦，生态工程建设，草场改良等；一类为多种经营项目，包括种植业（粮棉油等主要农产品生产以外的）、养殖业、农副产品初加工等；一类为农业高新科技示范项目，包括生物、信息、材料等方面的高技术和先进适用的新技术。并在土地治理项目加强“四个重点”项目，即：优质粮食生产基地、优质饲料粮生产基地、节水农业、农业生态工程建设。2000年云南省农业综合开发在抓好3.73万公顷中低产田改造的同时，专项安排了8个优质粮食生产基地、3个优质饲料粮生产基地、2个节水农业示范项目、2个专项生态造林项目，发展优质粮食1.06万公顷、优质饲料粮2 666.6公顷，逐步把农业综合开发的建设内容引向深入。
1996年后，滇西南农业综合开发区与金沙江流域农业综合开发区合并统称为云南省农业综合开发区，到1999年，全省农业综合开发区共包括潞西市、瑞丽市、陇川县、盈江县、梁河县、保山市、昌宁县、腾冲县、龙陵县、施甸县、临沧县、双江县、沧源县、耿马县、镇康县、永德县、思茅市、景东县、景谷县、孟连县、普洱县、澜沧县、景洪市、勐海县、勐腊县、中甸县、丽江县、华坪县、永胜县、宁蒗县、祥云县、宾川县、洱源县、鹤庆县、楚雄市、元谋县、姚安县、禄丰县、永仁县、嵩明县、富民县、安宁市、寻甸县、东川区、禄劝县、会泽县、陆良县、罗平县、马龙县、昭通市、鲁甸县、永善县、巧家县等53个县(市、区)。
1996—1998年，云南省农业综合开发共完成项目投资114 247.7万元，其中：中央财政资金22 420万元，地方财政配套资金41 749万元，农业综合开发专项贷款27 680.5万元，单位及群众自筹资金21 923.1万元，引进其他资金474.9万元。完成改造中低产田11.51万公顷，开垦宜农荒地3 800公顷，改良土壤4.78万公顷，营造防护林2.04万公顷，示范推广先进适用技术17.37万公顷，3年共修建小型水库18座，拦河坝13座，排灌站15座，开挖疏浚渠道1 573千米，衬砌渠道1 973千米，修建桥涵闸渡槽8 659座，新打及修复配套机电井139眼，埋设地下管道129千米，建设机耕路995千米，新建和扩建良种基地面积4 266.6公顷，新增灌溉面积1.90万公顷，改善灌溉面积5.02万公顷，新增除涝面积5 866.6公顷，改善除涝面积31.13万公顷。粮食生产能力实际增加27 681万千克，油料1 052万千克，糖料（甘蔗）125 402千克，肉类177万千克，农民人均纯收入增加258元。