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化学物的化学结构与效应之间的关系。包括基本骨架、立体构形、活性基团及侧链长短等。活性基团是化学物作用特异性的物质基础。结构近似的药物常能引起相似或相反的作用(称为拟似药或对抗药)。结构完全相同的光学异构物,却可能有完全不相同的作用。在基本骨架上由于侧链长短的差异,可形成药理效应从量变到质变的同系物。了解构效关系有助于定向合成新药及理解药物作用原理。在毒理学研究中可作为预测毒性,推断毒性作用机理的手段。
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