1641年

《明史·五行志》之“蒿庵闲话”中，记载了大豆褐斑病。
方以智 《物理小识·鸟兽类上·鸭》篇记载了以灶孵鸭的方法，至今仍被广泛使用。

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医学

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1641年

基歇尔[德]在罗马出版早期关于磁学的论著《磁石，或者论励磁的方法》，其中较引人注目的是他对磁力的测量。

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天文学

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1641年

方中通《数度衍》刊行。正文24卷，附录1卷，较详细地解释了西方的对数理论。

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地学

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1641年

文学家张溥卒。张氏为太仓人，崇祯进士，组织复社，进行文学政治活动。辑《汉魏六朝百三名家集》等。

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1641年

胡正心著成《万病验方》一书，其中记载了蒸熏鼠疫患者的衣物以防止鼠疫传染的方法。

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1641年

3月，枢辅杨嗣昌自杀于重庆。
8月，张献忠与左革五营合军，势盛，转战鄂豫皖，明廷改东厂衔称提督，京营称总督。

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是年

荷兰、西班牙为争霸台湾而战，荷兰胜，遂独占台湾。

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1641年

2月，清申禁烟。

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1641年

徐霞客卒于江阴。他从22岁起就开始出游，考察名山大川，足迹遍及现在的江苏、浙江、山东、河北、山西、陕西、河南、安徽、江西、福建、广东、广西、湖南、湖北、贵州、云南诸省。其中1636年9月19日当他50岁时开始的西南游历，历时最长、行程最远，是中国古代最大的一次地理考察。在这些考察中取得了极丰富的成就：一是关于西南岩溶地形的考察，是世界上对岩溶地形最早的研究，较欧洲爱斯贝尔研究喀斯特地形早100多年。他对岩溶地形进行分类和命名较诺曼的系统分类早200多年。并提出岩溶发育的地区性差异，对岩溶地形的成因作了分析。二是考察了云南腾冲附近的火山活动、温泉等自然现象，并记载了从地热蒸气中提取硫磺和硝矾的情况。这是有关利用地热和从地热蒸气中提取化工原料最早的科学记载，并对现在开发利用地热有一定的价值。三是阐述了地下水压力原理。四是对河流的下切和侵蚀作用作了理论上的阐释。他把30多年的游历考察中，对山川、河流、地质、地貌、水文、气候、动植物以及风土人情都作了详实的记录，写下20卷共40多万字的巨著《徐霞客游记》。

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农学

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1641年

2月，李自成攻下洛阳杀福王朱常洵，赈饥民。张献忠略开县。2月，张献忠下襄阳缚襄王朱翊铭，利用他计得杨嗣昌军饷兵器无数，并赈饥民，遂杀之。又破当阳等，至河南攻商城等地。
3月，锦州告急，命洪承畴为蓟辽总督，会八镇兵马10余万援锦州，时清兵攻锦州数月。张献忠攻应城，破随州。
5月，李自成陷南阳，张献忠陷泌阳。
6月～7月，罗汝才依李自成于内乡，合攻邓州，不利。
8月，张献忠攻郧阳不克；后改攻信阳，被左良玉击败后依李自成。罗汝才阴与张献忠五百骑使遁去。清帝统兵援攻锦州，以别军夺明军塔山堡资粮，明军无粮不敢野战，清军夜断明军归退路。明六总兵更番殿后严阵而退，大同总兵王朴先逃，军无行列。宁远总兵吴三桂、密云总兵唐通、辽东总兵白广恩相继溃入杏山。清军击塔山，吴三桂、王朴残卒由杏山逃出，又遇伏兵，2人仅以身免。洪承畴、邱民仰、曹变蛟被困松山，是役明军死5万余，锦州之围益急，松山大败，此即“松山之战”。
9月，李自成新蔡俘杀陕西总督傅宗成。李自成破项城叶县。
11月，李自成用军师宋献策计欲取南阳以图关中，破南阳、邓州等，杀唐王朱聿镆。总兵官猛如虎等于南阳援绝战死。

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1641年

笛卡儿的哲学名著《形而上学的沉思》在巴黎以拉丁文出版。

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政法

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1641年

葡萄牙国王若昂四世与法国结成反西班牙的同盟。次年，出兵西班牙，取得了奥利文萨战役和贝拉保卫战的胜利。
荷兰占领马六甲。

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1641年

6月，两畿、鲁、豫、浙、湖广旱，蝗灾。

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1641年

1月13日，霍罗克斯逝世。他修正了兰斯贝格和开普勒的天文图表；对希帕克关于太阳视差的估计值作了第一次改进，确定为14″ ～15″；推广了开普勒的行星理论，认为不仅在太阳和行星之间存在引力，而且行星之间、行星与卫星之间也有引力，并以此来解释月球轨道的摄动，他还首先提出了月球以椭圆轨道绕地球运转的理论；发现了土星和木星运行速度的不平均性。