1639年

日本德川幕府发出最后的锁国令，将外商和传教士驱逐出境；封锁港口，仅中国、荷兰商船得在长崎港通商；国内船只须持有“御朱印状”方可出国。
英国占领马德拉斯，开辟为贸易港。
英国伦敦失业手工业者举行大规模游行、暴动。
法国诺曼底人发动“赤足汉”起义，起义军焚毁税局、杀死税吏。

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军事

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1639年

在弥尔顿等人推动下，英国议会批准成立向现代形式过渡的中学——“阿卡德米(Academy)”，将自然科学、实验等多种学科纳入中学教学体系，并尝试使用英语教学。

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政法

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1639年

卡斯泰利[意]发明雨量筒，开始观测降雨量。

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工程技术

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1639年

11月24日，霍罗克斯[英]和克雷布特里[英]在不同地点独立观测到霍罗克斯预测的金星凌日现象。霍罗克斯在《通过太阳圆面的金星》一文中作出这项预言时还指出，根据从不同的天文台观测到的凌日现象所产生的视差效应，可以计算出金星的距离，进而确定太阳系的大小，这些预言后来都被证实。

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医学

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1639年

2月，清破山东临邑等县，占济南俘德王朱由枢等。
4月，左良玉等破义军于南阳等地。
5月，张献忠复起谷城，罗汝才应之，破房县、保康。
8月，周遇吉败义军胡可受于淅川。
9月，清遣兵略锦州、宁远。
12月，罗汝才攻四川。

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1639年

2月，改洪承畴总督蓟辽，孙传庭总督保定、鲁、冀军务。
3月，清军攻明，深入2000里，33战捷，饱夺金、银，掠46万人还之。
6月，清分汉军为四旗，旗色皆元青。清帝致书明，仍言修好事。
8月，罢熊文灿职，命杨嗣昌督荆襄军务，领兵10万围攻张献忠。
11月，命吴三桂为辽东总兵官。
12月，清官使朝视查李倧勒纪念碑。

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经济

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1639年

6月，以枢辅杨嗣昌议定“剿饷”外加征“练饷”730万两，增赋1 670万两。

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军事

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1639年

10月，《保民四事全书》成，颁天下。清遣喇嘛致书图伯特（西藏）。

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是年

文学家、书画家陈继儒卒。陈氏著《陈眉公全集》，编《宝颜堂秘籍》、《国朝名公诗选》等。

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政法

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1639年

徐光启的《农政全书》经陈子龙整理修补后，由应天巡抚张国维、松江知府方岳贡刊行。全书共12目60卷，内容有农本、田制、农时(包括营治、开垦、授时、占候)、水利、农器、树艺（谷类及蔬果各论）、蚕桑、蚕桑广类(棉、麻、葛)、种植（竹木及药用植物）、牧养、制造、荒政。从制订全国性的农业政策的角度进行论述。还总结了棉花等农作物的种植技术，对许多问题有独创性的见解。
《农政全书》第44卷《治蝗疏》中，记载了徐光启对蝗虫的生活规律的系统研究，并据此提出捕蝗方法等，是中国农学史上第一部关于治蝗的论文。

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医学

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1639年

卡瓦列利出版《一百道杂题》一书。该书实际上用卡瓦列利定理（他没有明确给出表述）证明了指数的积分公式：

笛沙格[法]的《试论锥面截一平面所得结果的初稿》在巴黎出版。该书以开普勒的连续性学说为出发点，引进无穷元素，以新的指导思想推导出关于极点和极线、透射、透视、直线上的点集对合、点和直线关于二次曲线的对偶关系的基本原理，初步建立了射影几何学，解决了一些画法几何学问题。

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物理学