在HACCP准备阶段中，第4阶段即制造工序一览图、设施平面图及标准作业程序书编制阶段是很重要的。这一阶段从QCD方面看，需要积极评价生产线的合理化，实现机械化的人员精简、压缩物流经费和库存，这就要从质量、生产效率、操作性、设备配置和卫生保持(清洗消毒)等方面分析是否存在矛盾、不合理和浪费之处，彻底重新评价车间布置和人流、物流等。在充分研究的基础上进行全面整顿，反复进行这一过程，以提高技术力。建立HACCP的优点就在于此，通过这一操作可以制定优秀的HACCP计划。
例如，研究物流有无浪费，中途有无停顿，是否有无用运输和工序，研究生产效率提高5%～10%并物流顺畅的车间布置。还有是否可以进行设备的维修管理、清洗消毒是否繁杂等，均要重新评价操作性。
在以上基础上完成SSOP(卫生标准作业方法)并按以下事项就实施负责人、作业内容、实施频率、实施状况的确认和记录方法作成文件，使操作者共同遵守，同时用记录确认实施状况。
①设施设备、机械器具的卫生管理；
②设施设备、机械器具的维护、检修；
③操作人员的卫生教育；
④鼠、昆虫等的防除；
⑤用水的卫生管理；
⑥排水及废弃物的卫生管理；
⑦操作人员的卫生管理；
⑧食品等的卫生管理；
⑨产品等的回收方法；
⑩产品等试验检查用的仪器、器具的保养和维修。