非淋在我国目前仍以临床诊断为主，即根据病史、体检、尿道分泌物的性状和量及实验室检查。革兰氏染色后的尿道分泌物涂片在显微镜油镜下观察，平均每个视野的脓细胞多于5个时为阳性。此外，从尿道或宫颈采取细胞标本检查衣原体的包涵体，衣原体培养和用试剂盒检查衣原体的抗原，都是有用的方法。另外，检测标本中衣原体DNA的方法已经建立，并已制成质粒和染色体DNA探针。
对支原体感染的检查主要是从标本分离支原体并进行鉴定。目前用于分解尿素支原体临床标本分离和鉴定的培养基有尿素酶颜色试验培养基UaB和鉴别琼脂培养基A7B2，其集落比其他支原体小。也可以用琼脂弥散法和琼脂表面集落的免疫荧光染色等。其他许多能检出支原体感染时很低水平抗体的血清型方法也已建立，然而在常规诊断中还没有显示出很大价值。