将穴位归属于一定的经脉通路上，称为穴位的归经。古人对经络穴位的认识经过了由点连线，同类归经，经上布点的发展历程。进而认识到十四经脉是经络的主要组成部分，各条经脉在体表都有其气血输注的穴位分布。当受到病邪侵袭时，每条经脉都会表现出各自的外观病理体征，各经局部和远端发生的疾病均可用该经的穴位来治疗。在临证应用中，主要采用循经取穴和表里相配的原则。即当探诊到某经及其所属脏腑有病时，则主要在该经选配穴位，给予适当的针灸刺激，以调整气血，加强或抑制脏腑机能，使其趋于平衡协调，而达到治疗疾病的目的。
关于动物穴位的归经，《元亨疗马集》仅提到“马、牛周身有十二道经脉”；每一条经脉只提到一个代表穴位，如胸堂心之经、鹘脉肺之经等，对十二经脉的具体循行路线和其他经穴却没有记载。现代研究也证明动物经络和穴位的客观存在，不少文献报道了动物经脉循行路线和所属穴位，但尚未得到公认，值得进一步探讨。