水是构成生物体的重要组成。生物体内的一切生物化学作用都需要水，营养物质和代谢产物都是在水溶液状态下被吸收和运输的。所以卤水质量对盐田生物的发展和限制起着主导的作用。测定卤水的温度、水色、粘度、透明度、泡沫多少、pH值、溶解氧、氮、磷、盐度、卤水组成和微量元素、氨和氨盐、硝酸盐和亚硝酸盐、有机碳、总磷、总盐量等各项基本指标，可作为盐田生物发生及消长规律的重要依据。检查原盐的颗粒大小、颜色、晶形、包裹体漏斗晶以及水分和不溶物的含量。盐质高低是衡量该生物系统中生物发生情况的主要标志之一。此外查明土壤质地和渗透率也很必要。